Zastosowanie grafowych sieci neuronowych w projektowaniu leków
🟢 Warsztat weekendowy w godz. 09:00-17:00 (8 h) 🟢
Czego się nauczysz?
- Budować grafy i wykonywać na nich proste operacje,
- Generować grafy z cząsteczek chemicznych,
- Implementować, optymalizować i walidować grafowe sieci neuronowe (klasyfikatory i regresory).
Dla kogo jest ten warsztat?
- Trenowały już modele uczenia maszynowego, w szczególności sieci neuronowe i chcą poznać praktyki stosowane w sieciach grafowych,
- Chcą poszerzyć swoją wiedzę domenową z obszaru chemii i farmacji o podstawy informatyki chemicznej.
Wymagania wstępne
Prowadzący
Specjalista ds. Informatyki Chemicznej w Merck KGaA od 2020 roku. Na co dzień zajmuje się rozwojem i utrzymywaniem backendu aplikacji do retosyntezy "Synthia" oraz projektami na styku informatyki chemicznej i uczenia maszynowego. Doktor nauk medycznych i nauk o zdrowiu w dyscyplinie nauki farmaceutyczne oraz absolwent Bootcampu Data Science Pro w Sages. Chętnie łączy wiedzę domenową z programowaniem. Doświadczenie dydaktyczne zdobył na Warszawskim Uniwersytecie Medycznym. Szkolenia traktuje jako sposób na oszczędzenie czasu słuchaczom poprzez przekazywanie wiedzy w możliwie esencjonalny i prosty sposób.
Program warsztatów
1. Wstęp teoretyczny.
– Pojęcie grafu, rodzaje grafów i podstawowe algorytmy grafowe.
– Reprezentacje cząsteczek chemicznych.
– Zasada działania grafowych sieci neuronowych.
2. Przegląd podstawowych funkcjonalności bibliotek operujących na grafach.
– NetworkX.
– RDKit.
– PyTorch Geometric.
3. Eksploracyjna analiza danych.
– Kontrola histogramów cech.
– Kontrola wartości odstających.
– Porządkowanie danych wejściowych.
4. Grafy cząsteczek chemicznych.
– Generowanie.
– Analiza.
– Przygotowanie zbioru danych.
5. Grafowa sieć neuronowa.
– Trenowanie.
– Optymalizacja hiperparametrów.
– Walidacja.
6. Publikacja modelu dla użytkowników.
Uwaga
Zakupione certyfikaty zostaną przesłane uczestnikom w formie elektronicznej po warsztacie. Jeśli chcesz otrzymać zakupiony certyfikat w formie papierowej, zgłoś to mailowo na adres kontakt@stacja.it.
Zapisz się na warsztat
Liczba miejsc ograniczona! Organizator zastrzega sobie prawo do odwołania wydarzenia w przypadku niezgłoszenia się minimalnej liczby uczestników. Zakupione certyfikaty zostaną przesłane uczestnikom w formie elektoronicznej po warsztacie oraz za pośrednictwem firmy kurierskiej.