#1025

[ODWOŁANY] Zastosowanie grafowych sieci neuronowych w projektowaniu leków

Warsztat odbywa się w formie zdalnej za pośrednictwem platformy/komunikatora online, z wykorzystaniem dźwięku, obrazu z kamery, udostępniania ekranu komputera prowadzącego i uczestników.

? Warsztat weekendowy w godz. 09:00-17:00 (8 h) ?

Czego się nauczysz?

Podczas warsztatu nauczysz się, jak:
- Budować grafy i wykonywać na nich proste operacje,
- Generować grafy z cząsteczek chemicznych,
- Implementować, optymalizować i walidować grafowe sieci neuronowe (klasyfikatory i regresory).

Dla kogo jest ten warsztat?

Warsztat jest skierowany do osób, które:
- Trenowały już modele uczenia maszynowego, w szczególności sieci neuronowe i chcą poznać praktyki stosowane w sieciach grafowych,
- Chcą poszerzyć swoją wiedzę domenową z obszaru chemii i farmacji o podstawy informatyki chemicznej.

Wymagania wstępne

Na tym warsztacie wymagamy dobrej umiejętności programowania w języku Python oraz znajomość pakietu TensorFlow, PyTorch lub podobnego.

Prowadzący

Mateusz Rezler:

Specjalista ds. Informatyki Chemicznej w Merck KGaA od 2020 roku. Na co dzień zajmuje się rozwojem i utrzymywaniem backendu aplikacji do retosyntezy "Synthia" oraz projektami na styku informatyki chemicznej i uczenia maszynowego. Doktor nauk medycznych i nauk o zdrowiu w dyscyplinie nauki farmaceutyczne oraz absolwent Bootcampu Data Science Pro w Sages. Chętnie łączy wiedzę domenową z programowaniem. Doświadczenie dydaktyczne zdobył na Warszawskim Uniwersytecie Medycznym. Szkolenia traktuje jako sposób na oszczędzenie czasu słuchaczom poprzez przekazywanie wiedzy w możliwie esencjonalny i prosty sposób.

Program warsztatów

1. Wstęp teoretyczny.
– Pojęcie grafu, rodzaje grafów i podstawowe algorytmy grafowe.
– Reprezentacje cząsteczek chemicznych.
– Zasada działania grafowych sieci neuronowych.

2. Przegląd podstawowych funkcjonalności bibliotek operujących na grafach.
– NetworkX.
– RDKit.
– PyTorch Geometric.

3. Eksploracyjna analiza danych.
– Kontrola histogramów cech.
– Kontrola wartości odstających.
– Porządkowanie danych wejściowych.

4. Grafy cząsteczek chemicznych.
– Generowanie.
– Analiza.
– Przygotowanie zbioru danych.

5. Grafowa sieć neuronowa.
– Trenowanie.
– Optymalizacja hiperparametrów.
– Walidacja.

6. Publikacja modelu dla użytkowników.

Uwaga

Liczba miejsc ograniczona! Organizator zastrzega sobie prawo do odwołania wydarzenia w przypadku niezgłoszenia się minimalnej liczby uczestników.
Zakupione certyfikaty zostaną przesłane uczestnikom w formie elektronicznej po warsztacie. Jeśli chcesz otrzymać zakupiony certyfikat w formie papierowej, zgłoś to mailowo na adres kontakt@stacja.it.

Zapisy na wybrany warsztat zostały zakończone.